Der Museumshafen Flensburg liegt in unmittelbarer Nähe zum Schifffahrtsmuseum in der Flensburger Altstadt. Die Anlage des Museumshafens besteht aus der dem Bohlwerk, der darauf befindlichen Wachhütte, Steganlage, der Rekonstruktion des historischen Krans von 1726 zum Setzen oder Ziehen von Masten und dem Lüttfischerhafen, der als Hafen für offene Fischerboote genutzt wurde.